Senin, 02 Januari 2012

JChemPaint

Januari 2010: JCP 3.0.1 telah tersedia. Ini adalah rilis bugfix untuk 3.0. Download here atau lihat changelog.

Desember 2009: 
telah di rilis JCP 3.0. Ini adalah benar-benar desain yang dikerjakan ulang,menawarkan antarmuka yang lebih ramah kepada user. Telah dilakukan pengujian menyeluruh bahwa inilah yang lebih baik dan lebih stabil. Applet juga telah ditandai sehingga bisa melakukan IO dan itu lebih keil dan lebih cepat dari yang pernah ada. Downloads and atest page for the applet .

JChemPaint (atau JCP) adalah editor dan viewer untuk struktur kimia 2D dikembangkan menggunakan 
CDK. Hal ini diimplementasikan dalam beberapa bentuk: aplikasi Java dan dua varietas Java applet.


JChemPaint Editor applet

  • Sebuah applet adalah program Java yang berjalan hanya dalam halaman web.
  • Editor JCP memungkinkan pengguna untuk menggambar struktur kimia, dan untuk impor dan ekspor data struktur dalam plain-text format (SMILES, Molfile,CML)
  • Hal ini juga memungkinkan untuk pemrograman memuat dan menampilkanstruktur kimia, yang kemudian dapat diedit oleh pengguna.

Untuk demonstrasi, kelompok Steinbeck (EBI) host berbagai rilis dari applet. Anda dapat mencoba 
stable relase disini, or lihat development version. 

Sebuah snapshot dari applet rilis 3.0:
 
Untuk mempelajari cara memasukkan dan menggunakan applet dalam halaman web, lihatJChemPaint Inside Webpages.



JChemPaint Viewer applet

  • (Sebuah applet adalah program Java yang berjalan hanya dalam sebuah halaman web.) 

  • Penampil JCP hanya memungkinkan untuk pemrograman menampilkan struktur kimia, dimana pengguna tidak dapat memodifikasi. 

 

Untuk mempelajari cara memasukkan dan menggunakan applet dalam halaman web, lihat JChemPaint Inside Webpages. 

 

 

 

JChemPaint application 

  • Aplikasi adalah program yang berdiri sendiri. Perlu Machine Java yang terinstalVirtual untuk operasi. 
  • Aplikasi JCP memiliki semua fungsionalitas dari applet Editor JCP (lihat di bawah), ditambah file input dan output.
Berikut screenshot dari rilis 3.0:
 


Features 

  • Menggambar dan penghapusan ikatan tunggal, ganda, rangkap tiga.
  • Cincin template (3-8 atom) dengan satu-klik lampiran.
  • Sebuah perpustakaan dengan template yang luas.
  • Pewarnaan jenis atom, dan pengaturan rendering lainnya.
  • Mengedit no atom, isotop hidrogen dan menghitungnya.
  • Memuat dan menyimpan struktur di Kimia Markup Language (CML) dan sebagai file MDL MOL dan file SDF (loading saja).
  • Struktur Tata Letak Otomatis, juga dikenal sebagai Generasi Struktur Diagram.
  • Memuat struktur dari Internet menggunakan nomor CAS atau NSC.
  • Normalisasi struktur, saat ini terbatas untuk deteksi aromatisitas.
  • Menyimpan gambar bitmap dari struktur.
  • Struktur Menyimpan sebagai grafis (PNG, BMP, Scalable Vector Graphics (SVG)).
  • Postscript pencetakan. 

     

Sumber : http://sourceforge.net

Rabu, 14 Desember 2011


Analisa Dengan Hyperchem


Program HyperChem, merupakan program kimia aplikasi 32 bit, yang dikembangkan oleh HyperCube Inc untuk system operasi Windows 95/98 dan Windows NT. HyperChem merupakan program yang handal dari pemodelan molekul yang telah diakui mudah digunakan, fleksibel dan berkualitas. Dengan menggunakan visualisasi dan animasi tiga dimensi hasil perhitungan kimia kuantum, mekanika dan dinamika molekular, menjadikan HyperChem terasa sangat mudah digunakan dibandingkan dengan program kimia kuantum yang lain.
            Program Kimia menyediakan fasilitas pembuatan model tiga dimensi (3D), perhitungan mekanika molekular dan mekanika kuantum (semiempiris dan ab initio). Disamping itu tersedia pula database dan program simulasi Monte Carlo dan molecular dynamics (MD).
Fasilitas yang disediakan oleh program standar ini adalah:
·         Input Struktur dan Manipulasi (Structure Input and Mani-pulation)
·         Display Molekul (Molecular Display)
·         Kimia Komputasi (Computational Chemistry)
·         Metode Komputasi (Computational Methods)

HASIL PERHITUNGAN DENGAN HYPERCHEM
Prediksi:
            HyperChem dapat digunakan untuk menentukan bebe-rapa sifat struktur antara lain :
·   Stabilitas relatif dari beberapa isomer
·   Panas pembentukan
·   Energi aktivasi
·   Muatan atom
·   Beda energi HOMO-LUMO
·   Potensial Ionisasi
·   Afinitas elektron
·   Momen dipol
·   Tingkat energi elektronik
· Energi korelasi elektron MP2
·   Energi keadaan tereksitasi CI
·   Sifat dan struktur keadaan transisi
·   Energi interaksi non-bonded
·   Spektra serapan UV-VIS
·   Spektra Absorpsi IR
·   Pengaruh isotop pada vibrasi
·   Spektra serapan IR
·   Efek Collision pada sifat struktur
·   Stabilitas dari kluster

Simulasi
  • Interaksi Docking
  • Pengaruh temperatur pada gerakan molekul
  • Pengaruh pelarut pda struktur dan dinamika
  • Interaksi intermolekular pada kluster     


sumber : kimia.unnes